MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA504

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017497	TGA	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836923
2	NC_017497	CGAA	2	8	228	235	50 %	0 %	25 %	25 %	385836923
3	NC_017497	CTT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836923
4	NC_017497	AAT	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836923
5	NC_017497	A	6	6	447	452	100 %	0 %	0 %	0 %	385836923
6	NC_017497	AT	3	6	480	485	50 %	50 %	0 %	0 %	385836923
7	NC_017497	TAA	2	6	603	608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836924
8	NC_017497	TAA	2	6	738	743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836924
9	NC_017497	GAT	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836924
10	NC_017497	GTT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836924
11	NC_017497	ATT	2	6	865	870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836924
12	NC_017497	ATG	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836924
13	NC_017497	A	7	7	1125	1131	100 %	0 %	0 %	0 %	385836924
14	NC_017497	GTA	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836924
15	NC_017497	TCGT	2	8	1319	1326	0 %	50 %	25 %	25 %	385836924
16	NC_017497	A	6	6	1426	1431	100 %	0 %	0 %	0 %	385836924
17	NC_017497	AAGTG	2	10	1491	1500	40 %	20 %	40 %	0 %	385836924
18	NC_017497	GAG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836924
19	NC_017497	AACG	2	8	1524	1531	50 %	0 %	25 %	25 %	385836924
20	NC_017497	ATTG	2	8	1579	1586	25 %	50 %	25 %	0 %	385836924
21	NC_017497	TCTGAT	2	12	1612	1623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385836924
22	NC_017497	A	8	8	1649	1656	100 %	0 %	0 %	0 %	385836924
23	NC_017497	CCA	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836924
24	NC_017497	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836924
25	NC_017497	AAG	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836924
26	NC_017497	CCAAAC	2	12	1790	1801	50 %	0 %	0 %	50 %	385836924
27	NC_017497	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836924
28	NC_017497	ACA	2	6	2347	2352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836925
29	NC_017497	TGA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836925
30	NC_017497	AAT	2	6	2431	2436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
31	NC_017497	AAT	2	6	2539	2544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
32	NC_017497	ATGC	2	8	2618	2625	25 %	25 %	25 %	25 %	385836925
33	NC_017497	TGCT	2	8	2733	2740	0 %	50 %	25 %	25 %	385836925
34	NC_017497	TTA	2	6	2824	2829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836925
35	NC_017497	TC	3	6	2832	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	385836925
36	NC_017497	TGT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836925
37	NC_017497	TTGG	2	8	2902	2909	0 %	50 %	50 %	0 %	385836925
38	NC_017497	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836925
39	NC_017497	TGA	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836925
40	NC_017497	ATA	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
41	NC_017497	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
42	NC_017497	TACA	2	8	3089	3096	50 %	25 %	0 %	25 %	385836925
43	NC_017497	T	6	6	3122	3127	0 %	100 %	0 %	0 %	385836925
44	NC_017497	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	385836925
45	NC_017497	TGATT	2	10	3145	3154	20 %	60 %	20 %	0 %	385836925
46	NC_017497	GAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836925
47	NC_017497	GAC	2	6	3254	3259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836925
48	NC_017497	TGCG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	385836925
49	NC_017497	TGGC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	50 %	25 %	385836925
50	NC_017497	ACA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836925
51	NC_017497	CTTT	2	8	3399	3406	0 %	75 %	0 %	25 %	385836925
52	NC_017497	TGG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836925
53	NC_017497	TGA	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836925
54	NC_017497	TCAA	2	8	3532	3539	50 %	25 %	0 %	25 %	385836925
55	NC_017497	TGT	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836925
56	NC_017497	ACG	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836925
57	NC_017497	TTA	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836925
58	NC_017497	ACA	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836925
59	NC_017497	TTG	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836925
60	NC_017497	TTC	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836925
61	NC_017497	GTG	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836925
62	NC_017497	A	6	6	3715	3720	100 %	0 %	0 %	0 %	385836925
63	NC_017497	TCA	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836925
64	NC_017497	A	7	7	3730	3736	100 %	0 %	0 %	0 %	385836925
65	NC_017497	CAT	2	6	3739	3744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.